Nació en Salta en 1803, hermano menor del General Martín Miguel de Güemes, ingresó en el Ejército del Norte como ayudante del general Manuel Belgrano a los diez años, durante la batalla de Salta. Prestó servicios en la guerra gaucha como oficial en repetidos enfrentamientos, pero sobre todo como correo y emisario de su hermano ante los oficiales subalternos, que debían actuar separados, aunque unidos por la coordinación del caudillo. En 1820 se distinguió en la defensa de la ciudad de Salta, siendo ascendido a teniente coronel: tenía 17 años.

Tras la muerte del caudillo, se dedicó a hacer política en el ejército, aliado del gobernador José Ignacio Gorriti. Participó en la revolución de 1827 contra el gobernador Juan Antonio Álvarez de Arenales, y en la campaña de Gorriti a Catamarca y La Rioja en 1830. Fue nombrado comandante de Tilcara, en la Quebrada de Humahuaca

Al caer derrotada en la batalla de La Ciudadela la Liga del Interior, dirigió una sublevación de la provincia de Jujuy contra el gobernador Rudecindo Alvarado, forzando su renuncia. Ocupó el mando provisoriamente Francisco de Gurruchaga, para ocuparlo después el general oriental Pablo Alemán. Pocos días más tarde, Güemes lo sorprendió en Salta y lo obligó a renunciar; Ejerció la Gobernación de Salta desde el 6/12/1831 al 8/2/1832, después del triunfo de Quiroga contra La Madrid en la Ciudadela; fue su ministro Amancio Alcorta.

Fue derrotado en Los Cerrillos el 8 de febrero de 1832 por fuerzas comandadas por el Cnel. Pablo de la Torre.

Emigró a Bolivia ese mismo año, y participó en una serie de conjuras de los unitarios en el destierro. Cansado de intrigas, después del asesinato de Latorre, regresó pacíficamente a Salta donde falleció el 13 de diciembre de 1840.