Nació en Salta, 30 de Julio de 1783 , hermano de Mariano Boedo. Siendo joven se caso con Francisca Javiera Lesser, pero al igual que se hermano no decido vivir un vida traquila apartado de la realidad de su tiempo sino se involucro en ella y es asi que se unio a las Fuerza de la Patria. Actuó en las filas del ejército patriota junto al general Belgrano. Fue ascendido al grado de capitán. Cruzó Los Andes a las órdenes del coronel Las Heras. Murió el 6 de diciembre de 1817 en el Combate de Talcahuano, siendo comandante del Tercer Batallón de Infantería.
En 1817 después de la batalla de Chacabuco, el comandante Barañao con 800 jinetes que no llego a tiempo para intervenir en Chacabuco y los fugitivos de la batalla que no lograron embarcarse en Valparaíso, se reunieron bajo el mando del coronel José Ordóñez, que tampoco había participado en ése encuentro. En pocos días el nombrado jefe realista reunió alrededor de 1.000 hombres y se fortificó en Talcahuano, donde contaba con la cooperación de algunas naves de guerra.
Los patriotas al mando de O'Higgins decidieron tomar por asalto la fortaleza de Talcahuano, por el temor de la llegada de una nueva expedición realista. El Gral. Las Heras lo acompaño con 4 batallones, 20 artilleros y 40 hombres con hachas, picos, palas, y escaleras. Su primer objetivo era el ataque, a El morro; y segundo, al cerro del Cura.
Poco después de las 2,45 hs. am, dos batallones se lanzaron al asalto; sufrieron elevadas pérdidas al atravesar el foso, pero lograron escalar la primera muralla que defendía el recinto. En seguida llegaron los otros dos batallones y utilizando escaleras penetraron en la fortificación. Los artilleros de las primeras baterías fueron aniquilados.
El intento de dos batallones para apoderarse del cerro del Cura fracasó debido a la eficacia del fuego enemigo y Las Heras quedo aislado en El Morro, intensamente batido por el fuego de la defensa. Cuando iba a emprender un nuevo ataque, recibió la orden de retirada impartida por O'Higgins.
El repliegue se efectuó a plena luz del día, bajo el fuego de los cañones de la plaza. No obstante, los patriotas llevaron sus heridos y no alteraron en momento alguno la formación ni el aire de marcha.
En el resto del frente patriota con tres batallones inició la aproximación hacia las posiciones enemigas simultáneamente con la agrupación de Las Heras. A poco de iniciado el combate las fuerzas de la Patria se lanzaron contra el enemigo; consiguiendo llegar hasta el foso, pero fueron rechazados con graves pérdidas. Las Fuerza patriotas perdieron ese día y los realistas mantuvieron Talcahuano en su poder y continuaron disponiendo así de un seguro lugar de desembarco y base para operaciones ulteriores, lo que habría de contribuir a la prolongación de la lucha por la independencia en territorio chileno. Fue en esta lucha donde el Heroico Salteño Juan Boedo murió gloriosamente por la Libertad de América en el ataque a la fortaleza de Talcahuano, un 6 de diciembre de 1817.
Hoy en dia una calle de Salta lleva su nombre en Villa Primavera zona sur de la capital.

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